Ош XVII кылымдын аягында — XVIII кылымдын башында
1638-жылы Моголистанда (Яркендде борбору менен) бийликти колго алган Абдаллах-хан өзүнүн мамлекеттеги абалын бекемдөө максатында Чыгыш Түркестанга жакын Кыргызстандын тоолуу аймактарын басып алууга чечим кабыл алат. Памирге (Болор жана Бадахшанга) болгон жортуулдарынан кийин Абдаллах-хан өз аскерлерин Ош шаарына тоноочулук чабуулдарга жөнөтөт. Эки жолу кыргыздар баскынчылыкты ийгиликтүү токтотушат, бирок көп өтпөй жеңүүчүнүн мээримине баш ийүүгө мажбур болушат. Чындыгында, Ошту басып алгандан кийин Абдаллах-хан кыргыз феодалдары менен физикалык жактан катаал мамиле кылууну чечпей, аларды өзүнүн тарапташы кылып, Чыгыш Түркестандагы атаандаштарына каршы күрөшүүдө пайдаланууга аракет кылат. Бул үчүн аларга чоң бийлик берип, жогорку аскердик кызматтарды жана маанилүү мамлекеттик кызматтарды ыйгарат.
Ошол убактан бери кыргыздар кашгар тактысына талапкерлердин ортосундагы күрөштө маанилүү роль ойноп башташат, бул теократиялык топтордун ( "ходжалар") ар кандай өкүлдөрүнүн арасында. Бул процесс XVII кылымдын аягында — XVIII кылымдын башында Жунгар хандыгы Чыгыш Түркестанды басып алгандан кийин улантылат. Бул күрөштүн жүрүшүндө кыргыздардын бир бөлүгү Тянь-Шандан жана Чыгыш Түркестандан Фергана өрөөнүнө сүрүлүп кетет. Бул жерде алар бир убакта саясий окуяларда чечүүчү роль ойноп, кочмондордун өзбек урууларыменен Бухара эмиратынан жана жунгар феодалдарынын агрессиясына каршы күрөшүүдө биргелешип чыгышат.
1684-жылы жунгар ханы Галдан Бошокту- хан Ошту басып алып, тоноп, Андижанга жөнөйт, бирок кыргыздар менен өзбектердин биригип каршылык көрсөтүшү менен артка кайтат. Бул кыргыздар жана өзбектер үчүн Ферганадагы саясий абалдын туруксуздугунда чоң ийгилик болду.
Ошо менен Оштун толук көз карандысыздыгынын кыска мөөнөтү башталат, ал кыргыз уруучулары тарабынан башкарылган болушу мүмкүн, алар өзбек феодалдары менен союзду сактап турушкан. Чыгыш хроникаларынын маалыматына ылайык, XVIII кылымдын башында Ферганада "кыргыз жана өзбек юз уруусу" негизги роль ойногон. Фергананы бухар династиясы Мангыттар тарабынан басып алынышында, аларга каршы негизги күч дагы ошол эле өзбектер жана кыргыздар болгон.
Орто Азия булактарында Коканд ханы Рахим-бийдин (1721/22— 1734—?) Самаркандга болгон жортуалы тууралуу маалыматтар бар. "Тарих-и Рахим-хани" деген эмгекте, мисалы, "Самарканд алты жыл бою кыргыздардын колунда болду..." деп айтылат.
1741-жылы жунгарлар (калмактар) Ферганага басып киришет, Кокандды курчоого алышат (бирок, көрүнөт, ал алынган эмес, бирок айрым Орто Азия булактары "бир аз каршылык көрсөткөндөн кийин" жергиликтүү бек Коканддын башкаруучусу менен бирге "бул кәпирлерге баш ийүүгө мажбур болушкан" деп билдиришет). Башка булактарда айтылгандай, Коканд ханы Абд ал-Карим-бий (1734—?—1750/51 ж.) жунгарларга өзүнүн мураскери Баба-бийди кепилдик катары берген, ушул менен аларды тынчтандырган. Карим-бий өлгөндөн кийин Баба-бий жунгарлар тарабынан Кокандга наместник катары жиберилет. Бирок "коканддыктар Баба-бийди жактырбай, калмактардын ортосундагы жикчилдиктерди пайдаланып, аны Биш-Арыкта өлтүрүшөт", ал эми Коканддын бекси болуп анын агасы Ирдана дайындалат. Ошентип, Коканддын Жунгар хандыгына болгон номиналдык көз карандылыгы өтө узакка созулбай, болгону Баба-бийдин башкаруу мезгилинде бир нече айга созулат.
Ош шаары бул окуяларга байланыштуу түздөн-түз аталбайт, бирок Ирдана аны басып алуу үчүн кыялданган объект катары карайт. Ал эми айланасындагы кыргыз уруулары жунгарлардын кол астына киргенин да формалдуу түрдө тааныбайт.
... Тиричилик өз жолунда уланууда. Жайкысын малчы малдары менен Алая жайлоосуна көтөрүлүп, дыйкан айланасындагы жерлерде нан, күрүч жана пахта өстүрөт, соодагер дехканчылар сезондук иштерин аяктап, товарларга келерине үмүттөнүп турат, ал убакта шеберлер товарларды даярдоого аракет кылышат. Бардыгы салык жыйноочулар менен жолугушууну ойлонуп, тынчсызданат. Эгерде салык басымы "төзүмдүн пружинасын" өтө кысса, ал ылдамдык менен түзүлүп, эксплуатациялаган адамдарга сокку урат. Феодалдардын элдик көтөрүлүштөрдү басып алгандан кийин, баары мурдагыдай эле өз ордуларында калышат, жана болгону ырларда жана легендаларда эл өзүнүн булутсуз келечеги, бактылуу жашоосу тууралуу кыялданат.