Кыргызстандын илимий потенциалы 92 өз алдынча илимий-техникалык мекемелерде, уюмдарда, ишканаларда, жогорку окуу жайларында, илимий-өндүрүштүк борборлордо, убактылуу чыгармачылык топтордо топтолгон.
Илимий чөйрөнүн негизги компоненттери Улуттук илимдер академиясынын илимий мекемелери жана Кыргыз Республикасынын Өкмөтүнө караштуу илим жана интеллектуалдык менчик боюнча мамлекеттик агенттиги тарабынан каржыланган жана координацияланган мекемелер болуп саналат, бул жерде тиешелүү түрдө 27 жана 59 илимий мекеме топтолгон.
Салыштыруу үчүн: 2000-жылдын башында Россия илимге 1% ИДП, Украина — 1,15%, Беларусь — 0,8%, Түркмөнстан — 0,5%, Армения жана Азербайжан — 0,4% жумшаган. Кыргызстандын деңгээлинде илимге жалгыз Тажикстан (0,1% ИДП) инвестиция салган.
1999-жылкы каттоонун программасына биринчи жолу илимий даражасы бар адамдар жөнүндө суроо киргизилген. Анын жыйынтыгы боюнча 2473 илимдин кандидаты жана 423 илимдин доктору катталган, алардын ичинен 2366 же 82% иштеп жатат. Илимдин кандидаттары жана докторлорунун жалпы санынын негизги бөлүгү (60%) билим берүү жана саламаттык сактоо тармагында, бештен бир бөлүгү — мамлекеттик башкарууда жана кыймылсыз мүлк операцияларында иштешет.
Илим тармагында иштеген адамдардын саны жыл сайын азаюуда. 1990-жылдан 2001-жылга чейинки мезгилдеги бул динамика 2.19-таблицада көрсөтүлгөн. 1990-жыл менен салыштырганда илимде иштеген адамдардын саны 5,4 эсе кыскарган, кыскаруу негизинен тармактык илимдердин адистеринин эсебинен болуп жатат. Адистердин санынын кыскарышына миграция, адистердин жеке жана башка структураларга өтүшү, жогорку эмгек акысы себеп болуп жатат.
Илимий-техникалык комплекс традиция боюнча өлкөнүн экономикасынын эң маанилүү объекттеринин бири болуп саналат жана негизинен мамлекеттик колдоосуз толук кандуу жашап жана өнүгө албайт.
Республикалык жыйында (2005-жылдын 15-октябры) Кыргыз Республикасынын Президенти К. С. Бакиев 2005-2006-жылдарга экономиканы өстүрүү боюнча приоритеттүү милдеттерди белгиледи. Бул өсүүнүн локомотиви өнөр жайды жандандыруу болушу керек. Кыргызстандын илимдеринин бир катар иштелмелери өлкөнүн ишканаларында колдонулууда. "Импульс" типтеги гидравликалык молоттор Бишкек - Ош жолун курууда жана реконструкциялоодо колдонулууда. Заманауи өлчөө-акпарат системалары жана оползневый процесс мониторингинин приборлору Майлуу-Суу шаарында Токтогул гидроузелинин тоо боорлорун мониторингдөөдө колдонулууда. Кытай — Кыргызстан — Өзбекстан темир жолунун долбоорунун инженердик-геологиялык жана геомеханикалык компоненттери өкмөттөр аралык келишимдин негизин түзөт (Кыргызстан, Өзбекстан, Кытай).
Катуу айыл чарба калдыктарын биогаз жана өсүмдүктөрдүн өсүшүн стимулдаштыруучу, биоудобренияларды өндүрүү технологиясы ОАО "Факел" ишканасында колдонулуп жатат. Алар Чүй жана Жалал-Абад облустарындагы чарбаларда колдонулат. Ботаникалык бакта түзүлгөн жаңы жогорку түшүмдүү алмурут жана слива сорттору Кыргыз Республикасынын аймагында колдонууга уруксат берилген өсүмдүктөрдүн сорттору жана гибриддери боюнча мамлекеттик реестрге киргизилген. Жергиликтүү туздан медициналык физиологиялык эритмелер, инфекциялык ооруларды дарылоого арналган вакцина, "Антизоб" йоддолгон туз Институт биотехнологиясынын эксперименталдык базасында өндүрүлөт. Ветеринария жана медицина үчүн грек жаңгагынын негизинде дары-дармектер "Кыргыз-жангак" илимий-өндүрүштүк борборунда чыгарылат.
Кыргызстандык плазмалык технологиялар машиналардын жана механизмдердин бөлүктөрүн калыбына келтирүү жана бекемдөө Россияда, Украинада, Малайзияда, Францияда колдонулат; жарылбайт технологиялар казакстанда, альтернативдүү энергия булактарын колдонуу технологиялары Монголияда колдонулат. КХМЗ-Астра (пгт. Орловка) монокремний жана синтетикалык алмаздар негизинде абразивдик инструменттерди өстүрүү үчүн армированный нитрид-кремний керамикадан тигилдерди өндүрүүнү үйрөндү. Кадамжайдагы сурьмяно-ртутный комбинатында сурьма жана мышьякты рудалык калдыктардан алуу үчүн ресурстарды үнөмдөөчү технологиялар иштелип чыккан. Бишкек шаарындагы бургу заводунда бургу кесүү кромкаларын плазмалык бекемдөө технологиясы колдонулду. Ош жана Жалал-Абад облустарындагы мармардын кендеринде, гранит жана волластонит кендеринде (Жалал-Абад облусу, Чүй облусунун Кемин районунда) таш казуучу жана таш кесүүчү машиналар жана агрегаттар колдонулуп жатат.

Академиялык илим секторунун негизги милдети жаңы билимдерди алуу үчүн жогорку деңгээлдеги фундаменталдык изилдөөлөрдү камсыз кылуу, ошондой эле Кыргызстандын үчүн приоритеттүү илим багыттарын өнүктүрүү болуп саналат. НАН республикадагы жана дүйнөдөгү жалгыз илимий борбор болуп, кыргыз элинин тарыхы, тили, фольклору, адабияты, коомдук ой-пикири боюнча комплексдүү фундаменталдык изилдөөлөрдү жүргүзөт.
Эркин рынок стратегиясы мамлекеттик билим берүү жана изилдөө кызматтарын уюштуруу боюнча көпчүлүк милдеттерди мамлекеттен алып салууну талап кылат, улуттук коопсуздук маселелеринен башка. Билим берүү жана изилдөө кызматтарын толугу менен жеке кызматтарга өткөрүп берүү үчүн структуралык өзгөртүүлөрдү жүргүзүү керек, анда кардарлар керектүү нерселерин түз төлөм менен сатып ала алышат.
Бирок, бул мамлекеттик илим жана билим берүү чөйрөсүндөгү ролунун кыскарганын билдирбейт. Мамлекет жоопкерчиликтин өзгөртүлгөн чегин белгилеп, башкарууну коомдук саясаттын аянтчасына, корпоративдик байланыштарды, союздарды жана университеттердин билим берүү реформалары боюнча мамилелерин түзүүгө өткөрөт.
Бирок, бул эркин рынок стратегиясын ишке ашыруунун бир гана жолу. Башка багыт дагы бар. Жеке сектор өлкөдөгү инновациялык ишмердүүлүктү каржылоону жогорулатууда.
Мамлекеттик бюджет технологиялык инновацияларга 15,1 млн сом же жалпы чыгымдардын 2% жумшаган, ал эми 98% инвестициялар жеке сектордун үлүшүнө туура келет. Мунун өзгөчөлүгү, бул жерде инновацияларды киргизүү этабы эске алынган. Изилдөө жана иштеп чыгуу этабы, адатта, мамлекет жана фонддор тарабынан каржыланат.
Мамлекеттик илимий-техникалык саясатты иштеп чыгуу төмөнкүлөрдү камтыйт:• илимдин мыйзамдык жана нормативдик-укуктук базасын заманбап экономикалык шарттарга ылайык жакшыртуу; илимий изилдөөлөрдүн экспертизасы үчүн стандартташтырылган методдорду иштеп чыгуу, алардын сапатын баалоо, НИРдин натыйжаларын натыйжалуулук жана талапка ылайык индикаторлорду түзүү;
• Кыргыз Республикасынын өнүгүүсүндөгү приоритеттерге багытталган илимий-изилдөө мекемелеринин тармагын оптимизациялоо; илимий кадрларды даярдоо үчүн экономикалык жана социалдык шарттарды түзүү, илимий эмгектин престижин жогорулатуу, изилдөө ишмердүүлүгүнүн натыйжаларына суроо-талапты жогорулатуу жана жаштарды илим чөйрөсүнө тартуу;
• илимди каржылоонун механизмин жакшыртуу жана рационалдуу пайдалануу;
• илимий-техникалык ишмердүүлүктү маалыматтык жана уюштуруу менен камсыздоону өнүктүрүү;
• республикалык региондордун илимий-техникалык потенциалын бекемдөө, аны жергиликтүү экономикалык приоритеттерди өнүктүрүүгө багыттоо;
• инновациялык ишмердүүлүктү өнүктүрүү, илимий иштеп чыгууларды экономикалык жүгүртүүгө киргизүү үчүн шарттарды түзүү, илимий продукция рыногун түзүү, дүйнөлүк жана региондук практика менен гармонияланган;
• эл аралык илимий-техникалык кызматташтыкты кеңейтүү, Кыргызстандын илим жана илимий-инновациялык ишмердүүлүк чөйрөсүндөгү интеграциялык процесстерге толук кандуу катышуусу үчүн шарттарды түзүү.
Билим берүү системасында кадрдык илимий потенциалдын топтолушу жана илимдин адистеринин башка тармактарга агып кетиши илимий ойлонуу борборун жогорку окуу жайларына жылдырууда жана билим менен илимдин интеграциясына табигый түрдө өбөлгө түзүүдө. Мамлекеттеги илимий кадрлардын көпчүлүгү жогорку окуу жайларында топтолгон. Мисалы, 2005-жылы илимдин докторлорунун көпчүлүгү өлкөнүн университеттеринде иштеген. Аспиранттар жана докторанттарды даярдоо да негизинен жогорку окуу жайларында жүрөт: 2004-жылы 83,6% аспиранттар университеттерде, ал эми болгону 16,4% илимий-изилдөө структураларында билим алган.
Мамлекет илимий-илим комплекстерин жогорку окуу жайлары жана республикадагы илимий мекемелер тарабынан Кыргыз улуттук университетинин Фундаменталдык илимдер институту, Кыргыз техникалык университетинин Физика-техникалык проблемалар институту сыяктуу түзүүнү стимулдаштырат жана колдойт.
Илимий-изилдөө институттары илимий жана инновациялык потенциалын сактап, илимий-техникалык саясат боюнча бир катар актуалдуу багыттар үчүн жооптуу мамлекеттик илимий-техникалык борборлорго (ГНТЦ) айланууда. Айрым ГНТЦлер Улуттук илимдер академиясынын академиялык институттарынын базасында түзүлөт.
Илимий жана конструктордук-техникалык уюмдардын бир бөлүгү инновациялык борборлорго жана технопарктарга айланууда, анын ичинде жайларды жана жабдууларды ишкерлерге, банктарга, башка инвесторлорго узак мөөнөттүү ижара (лизинг) шарттарында өткөрүү аркылуу.
Кыргызстанда коомдук кесиптик бирикмелер жана союздар кеңири таралган. Архитекторлор союз, Жазуучулар союз, Журналисттер союз, Кинематографисттер союз, Композиторлор союз, Музыкалык ишмерлер союз, Сүрөтчүлөр союз, Уулчулардын жана балыкчылардын коомдоштугу, Арачыктар коомдоштугу, "Билим" коомдоштугу, Көрүстөндөр жана кулагандар коомдоштугу, Коргоо спорттук-техникалык уюму, Өзгөртүлгөн өрт коомдоштугу, Жоокерлер, эмгек, Куралдуу күчтөр жана укук коргоо органдарынын ардагерлер уюму, Транспорт каражаттарынын айдоочуларынын союзу, Улуттук кызыл жарым ай коомдоштугу (НОКП), Кыргыз коомдоштуктарынын чет өлкөлөр менен достук жана кызматташтык союздары.