Археологдор Прииссыккульде байыркы адамдардын төмөнкү палеолит доорунда жашаганын билдиришет, бул тууралуу алар миңден ашык байыркы куралдарды тапкан. 1985-1989-жылдары Ысык-Көлдө суу астындагы изилдөөлөр жүргүзүлгөн. Суу астында калган шаарлардын калдыктарын издеп табышкан. Тарыхый жактан маанилүү болгон 2000-2500 жылдык бир нече баалуу буюмдар, орто кылымдагы жашоочулардын тушундагы тогуз жана байыркы доордун үч буюму табылган. Мындай табылгалардын бири - Чигу шаары (Кызыл өрөөнүнү шаары), Тюп бухтасында табылган, кочкор усундардын борбору жана Улуу Жибек жолундагы соода борбору катары белгилүү.
«Бул бардыгы өтө узак убакыт мурун болгон, күбөлөр жок, баары бир...» - манасчылар өз тарыхый ырларын ушул сөздөр менен башташат.
Тору-Айгыр айылына жакын жерде байыркы жайгашкан жердин калдыктары, ташка тартылган сүрөттөр, таштан жасалган фигуралар бар. Жа shoreда, «Улан» туристтик базасынын жанында, байыркы керамика заводуна тиешелүү калдыктар табылган, ал эми суудан: керамика, күмүш монеталар жана башка буюмдар табылган.
Бир айылдын калдыктары Тюп районунун Курменты айылына жакын суу астында жайгашкан. Бул жерде, болжол менен, Матфей апостолунун мощтору менен монастырь турган. Башка изилдөөчүлөр монастырь Тюп айыл чарба техникумунун аймагында, бүгүнкү күндө дагы миссионердик Святой Троицкий православный эркек монастырынын дубалдары турган жерде болгон деп эсептешет.
VII кылымдын 2-жарымынан тартып, Шелки жолу боюнча Прииссыккульдө жайгашкан жерлердин активдүү курулушу башталган.
Чингизхан ордолорунун Орто Азияга келишине чейин (XIII кылымдын башы) Прииссыккуль шаарлары гүлдөгөн жана байыган. Монголдордун жапырт чабуулдарынан кийин шаарлар бошотулуп, бул процесс кайтарымсыз болуп калды. Тимурдун жортуулдарынын жылнамачылары (XIV кылымдын аягында) Ысык-Көлдө маанилүү шаарларды белгилешкен эмес. Орто кылымдагы жайгашкан жерлердин акыркы жок болушун көл аяктады: XVI кылымга карата ал бардык шаарларды толугу менен суу менен каптады. Гидрографиялык жана археологиялык изилдөөлөр XI-XIV кылымдарда көлдүн деңгээли азыркыдан 6-6,5 метр төмөн болгонун көрсөттү.
Бүгүнкү күндө археологдор суу астында ондон ашык байыркы жана орто кылымдагы жайгашкан жерлерди билишет. Алардан сако-усунь доорунун (б.з.ч. I миң жылдык) көптөгөн тарыхый жана маданий баалуулуктар табылган: керамикалык кувшиндтер жана бронзадан жасалган казандар, орто кылымдын башындагы ар кандай металл буюмдар: хумы, казандар, монголо-тимурид доорунун идиштери, көк керамика, монеталар. Суу астында сүзүүнү жана археологияны сүйгөндөрдү жана археологдорду Ысык-Көлгө чакырат, бул жерде алар кызыктуу убакыт өткөрүп, эс ала алышат.
Ысык-Көлдүн суу астында калган шаарлары, алардын фрагменттери ачылган, клады издөөгө арналган冒险 программаларын түзүү үчүн уникалдуу туристтик продукт болуп саналат. Тарыхый илимдин маалыматы боюнча, көлдүн аймагында 200гө чейин чоң жана кичине клады болушу мүмкүн.