Санжыра, как исторический источник, по структуре состоит из легендарного и нескольких исторических пластов. Легендарная часть охватывает в основном предания о сорока девушках, как основу древнего исторического предания.
Рассказы об Угуз хане и Тюрк ата, а также имя знаменитого средневекового суфия Шейх-Мансура ал-Халаджа, вероятно, попали в санжыра под влиянием книжной культуры и деятельности мусульманских миссионеров. В числе легендарных предков последним упоминается в санжыра Шаа Мансур или Аналак (Аналхак). Среди легендарных предков особое место занимает Долон бий - родоначальник двух ветвей кыргызов.
Согласно санжыра, из потомков его сыновей Ак уула и Куу уула происходит деление кыргызов на правое крыло (он канат) и левое крыло (сол канат). Именно с этих событий начинается переход от легендарной к исторической части санжыра.
Историческая часть генеалогических преданий правого крыла обычно так же содержит имена легендарных предводителей. Судя по историческим рассказам, среди упоминаемых Тагай бий, возможно, был подлинным историческим лицом. Такую версию впервые выдвинул историк Белек Солтоноев. Опираясь на некоторые сходные моменты в биографии двух деятелей, историк отождествлял Тагай бия с предводителем
Моголистанских кыргызов Мухаммед-кыргызом. Все следующие за Тагай бием генеалогические имена правого крыла являются действующими историческими лицами XVII-XVIII вв. Санжыра сообщают их имена в связи с событиями указанных эпох, когда кыргызы отстаивали свою независимость. Цикл исторических преданий о сопротивлении кыргызов нашествию джунгаров охватывает целый исторический период.
Сравнительное изучение показывает, что запечатленные в санжыра события тех времен во многом совпадают с письменными источниками.
Санжыра охватывают полную историческую хронику этих событий.
Сведения санжыра историко-легендарного характера имеют большое значение в изучении вопроса этногенеза кыргызского народа. На основе этих данных можно проследить образование этнополитической дуальной организации и формирование этнического состава кыргызов.
С. М. Абрамзон разделяет на три пласта кыргызские этнонимы, встречающиеся в санжыра. Ученый датирует первый пласт VI-XI вв. н.э. и к этому периоду относит этнонимы, которые связаны с кругом древнетюркских и раннесредневековых племен. Это тоолёс, мундуз, кыпчак, канды, кушчу, арык, уйгур (подрод в составе теит), бугу, азык, солто, саяк, багыш, сары багыш, чон багыш, жедигер.
Происхождение следующего пласта кыргызских этнических групп относится к XII-XIV вв. По мнению ученого, данный период характеризуется двумя крупными историческими событиями; киданьским и монгольским вторжением на территорию обитания ряда тюркоязычных племен, в том числе вошедших несколько позднее в состав кыргызской народности. Это: кытай, нойгут, конурат, катаган, баарын, найман, керейит, меркит, кара кунас, ардай.
Третий пласт относится к периоду XV-XVIII вв., в него входили в основном монгольские элементы: баарын, балыкчы, барак, дуулат, керейит, кушчу(кутчу), монолдор, нойгут, баргы, булгачы, черик, которые когда-то вошли в состав основного ядра кыргызского народа, поэтому их названия закрепились в санжыре.
Санжыра и генеалогические связи кыргызов