Мамлекеттин климаттык шарттары анын географиялык жайгашуусунун жана рельефинин өзгөчөлүктөрү менен аныкталат. Кыргыз Тянь-Шанында, жогорку тоолуу системада, жер шарында белгиленген бардык климаттык типтер кездешет, тропикалык жана экваториалдыкты эсептебегенде. Субтропикалык широталык зонада, кеңири континенттин ичинде жайгашкан республика, нымдуу аба массаларын өткөрүү жолдорунан алыстатылган.
Мамлекеттин локалдык климаттык шарттарына чоң таасир эткен тоо чокулары, аны түндүктөн, чыгыштан жана түштөн коргоп, түндүктөн жана түндүк-чыгыштан келген суук аба массаларынын түз киришинен сактайт, ошондой эле жакынкы Кара-Кум жана Кызыл-Кум чөлдөрү. Республикадын ички континенталдык жана түштүк жайгашуусу аз булуттуулук, күндүн нурлануу узактыгынын жогору болушу (жылына 2537-2880 саат), күндүн радиациясынын жогору интенсивдүүлүгү, абанын жогору ионизациясы, узак мөөнөттүү тоңбогон мезгил (жылына 188 күнгө чейин) менен мүнөздөлөт.
Тоолуу аймактын мүнөзү үч климаттык белдемдин болушун аныктайт: төмөнкү тоолуу, орто тоолуу жана жогорку тоолуу. 500-1000 м бийиктиктеги белдемде, түндүк жана батышка караган, климат жарым чөлдүү.
Бул жерде жай ысык, кургак, июль айындагы орточо температура +25С, жылына жаан-чачын 150-350 мм гана түшөт. Кыш мезгилинде чек арадагы жана тоолор арасындагы өрөөндөрдүн температураларында чоң айырмачылыктар байкалат. Чек араларда кыш салыштырмалуу кыска жана жумшак, өзгөчө Фергана өрөөнүндө.
Суук кыш Ак-Сай, Арпа, Алая жана башка жогорку тоолуу өрөөндөрдө байкалат. 1200 м бийиктиктен жогору климат орточо-жумшак, жай жылы, кыш салкын. Жылына жаан-чачын 400-600 мм түшөт, негизинен жаз мезгилинде. 2000-3000 м бийиктикте климат орточо, жай салкын, кыш абдан суук жана узак. Жылдык жаан-чачындын көлөмү, өзгөчө батыш капталдарда, жылына 600 ммден ашат.
Жогорку тоолуу белдемде - 3000 м бийиктиктен жогору - климат катаал, июль айындагы орточо температура +10С дан төмөн, жаан-чачындын көлөмү жылына 700-800 мм чегинде өзгөрөт (Кыргызстандын табияты. 1962; Рязанов, Павленко, 1960).
Жыл бою жаан-чачындын бөлүштүрүлүшү тең эмес. Алардын эң көп бөлүгү күз-кыш жана жаз мезгилдерине туура келет. Республикага кирген аба массалары, жогорку тоолуу курулуштарды жолдо кездештирип, муздайт жана нымдуулукту конденсациялайт. Жанаша капталдар - батыш жана түштүк-батыш - чыгышка караганда көбүрөөк нымдалып турат. Бийиктиктен жана тоолордун капталдарынын жайгашуусунан көз каранды жылдык жаан-чачындын көлөмү чоң айырмачылыктарды көрсөтөт. 600-1000 м бийиктикте жылына 300-350 мм жетет. 2000-3000 м белдемде - жылына 600-800 мм. Фергана чокуларынын капталдарында жана Прииссыккульдын чыгыш бөлүгүндө чоң айырмачылыктар байкалат. Мисалы, көлдүн батыш жээгинде жаан-чачын жылына 115 мм, чыгышында болсо - 569 мм. Аба ырайынын минималдуу жаан-чачыны жана карсыз кыш мезгилине карабастан, ландшафттар өсүмдүктөрдүн вегетация мезгилинде жакшы нымдуулук менен мүнөздөлөт (Ракитников, 1960). Тоолуу жердин мүнөзү, деңиз деңгээлинен жогору бийиктиги жана рельефтин күчтүү бөлүнүшү табигый чөйрөнүн өзгөчө алуан түрдүүлүгүн жана ошол эле учурда табигый ландшафттардын алуан түрдүүлүгүн аныктайт.
