Министр имеет четыре заместителя, однако вакантной остается позиция заместителя по цифровому развитию. Ранее эту должность занимала Нургуль Аднаева, которая была назначена в апреле 2025 года.
На пост исполняющего обязанности министра назначен Каныбек Досмамбетов, ранее занимавший должность руководителя управления ГКНБ в Жалал-Абадской области.
Первым заместителем министра стал Айбек Маткеримов. Этот специалист в области медицины ранее служил депутатом Жогорку Кенеша VII созыва и имеет опыт работы заведующим родильным блоком в Ошском городском филиале территориальной больницы, а также врачом акушером-гинекологом в Жалал-Абадском областном родильном доме.
В числе назначенных заместителей также Бакытбек Кадыралиев, выдающийся кардиохирург, который работал в Институте сердца в Перми. С 2012 года он является практикующим кардиохирургом и ассистентом профессора С.Г. Суханова в Федеральном центре сердечно-сосудистой хирургии в Перми, а также вел студенческий научно-образовательный кружок в Пермской государственной медицинской академии имени Вагнера.
Еще одним заместителем был назначен Рыспек Сыдыгалиев. В период с 2008 по 2010 годы он трудился главным врачом Центра государственного санитарно-эпидемиологического надзора Токмока, а с 2012 по 2015 годы занимал должность главного санитарного врача Московского района. Кроме того, он возглавлял Центр госсанэпиднадзора в Бишкеке и был директором Департамента госсанэпиднадзора.
