Водные ресурсы имеют жизненно важное значение для экономики, человека и окружающей среды; Водные ресурсы являются важнейшим природным потенциалом, оказывающим влияние на развитие экономики региона. Среди природных ресурсов Кыргызстана большое место занимает находящаяся в ледниках пресная вода. Ее запасы оцениваются в 650 млрд м3. Ледники занимают 4,2% территории страны. Здесь находятся истоки бассейна Сырдарьи и других главных рек Центральной Азии.
Вода — один из наиболее ценных ресурсов в рамках Центральной Азии. И это в то время как около 70% продукции региона дает земледелие, которое в условиях аридного климата без воды бесплодно. В 2003 году на орошаемое земледелие в Кыргызстане приходилось 39%.
По уровню обеспеченности местным речным стоком на одного человека в год Кыргызстан во много раз превосходит другие государства региона. Кыргызстан — единственная страна Центральной Азии, водные ресурсы которой почти полностью формируются на собственной территории, и в этом ее гидрологическая особенность и преимущества, и это — одно из главных ее богатств. На территории страны насчитывается около 30 тыс. рек и ручьев, в том числе около 20 тыс. длиной более 10 км. С гор в долины стекает в среднем около 49 кв. км воды в год, но самой республикой используется только 25% этого количества. Большинство из них настолько чисты, что их можно использовать для нужд населения без очистки или с незначительной очисткой. Загрязняются реки в основном отходами животноводства.
Крупные реки — Чу, Нарын и Талас — берут начало в высокогорьях. Чу протекает на севере, по ней на протяжении 145 км. проходит граница Кыргызстана и Казахстана. Нарын, сливаясь с рекой Карадарья, образует Сырдарью, которая течет на восток, в Ферганскую долину. Талас дренирует северо-восточный Кыргызстан. Озер в КР около 2 тыс. Большинство из них невелико по размерам и расположено в среднегорной и высокогорной зонах.
Находясь в зоне формирования стока горных рек, Кыргызстан потребляет всего пятую его часть, постоянно испытывает серьезные трудности в защите от вредного воздействия рек на земли и население (паводки, оползни, размывы берегов, сносы земель и строений).
Кыргызская Республика, занимая практически всю западную половину мощной внутриконтинентальной горной системы Тянь-Шань и частично хребты Памиро-Алая, имеет хорошо развитое оледенение. Ледники — одно из природных богатств республики. По данным каталогизации, выполненной в рамках работ по программе МГД (1965-1974), на территории Кыргызстана насчитывается 7628 ледников, занимающих площадь 8107 км2.
По типу питания большинство рек относится к ледниково-снеговому и снегово-ледниковому, что говорит о значительной роли ледников и сезонных осадков, накопившихся в горах в течение холодного периода. Дождевые воды в общем объеме питания рек играют незначительную роль, но она возрастает и доминирует в случае дождевых паводков, часто носящих селевой, разрушительный характер.
Значительная часть территории республики (более 20%) находится в зоне вечных снегов и ледников, непригодна для жизни, но нуждается в стратегической защите, т. к. глобальное, антропогенное повышение температуры все ощутимее сказывается на режиме формирования речного стока и сокращает площадь оледенения. Резкое увеличение летних расходов воды за счет потепления климата, повлекшего активное таяние ледников, отмечается почти на всех реках Кыргызстана, имеющих ледниково-снеговое и снегово-ледниковое питание, после 1972 года. Тенденция потепления климата может привести в недалеком будущем к такому сокращению оледенения, при котором произойдет резкое уменьшение летних расходов воды в реках.
Ледники в середине XX века покрывали 4% территории КР. Однако последние 30 лет их объем сократился на 25-30%, а площадь — на 40%. Причины — глобальное потепление и высыхание Арала. Кроме того, активное таяние ледников — это не просто снижение запасов пресной воды для Центральной Азии, но и формирование гляциальных озер и, следовательно, растущая угроза разрушительных селевых потоков, которые уже не раз приводили к большим человеческим жертвам, деградации угодий и материальным потерям.
Питьевая вода в основном поставляется из подземных водных источников, но уже существуют предпосылки к ухудшению ее качества. Проникновение токсичных материалов из существующих и старых мест добычи несет угрозу водным ресурсам. К тому же домохозяйства, предприятия и сельскохозяйственный сектор нерационально расходуют водные ресурсы, а утечки из муниципальных мусорных захоронений загрязняют ресурсы.
В системе водопользования и водопотребления, внутрихозяйственных и межгосударственных водных отношений утвержден и действует Закон Кыргызской Республики «О воде», принятый 14 января 1994 года. Его главной особенностью является то, что он установил платность прав природопользования, а также услуг по водоподаче и штрафы за сбросы в водные объекты и водохозяйственные сооружения загрязняющих веществ.
Уменьшение растительного покрытия в водоразделах из-за выкорчевывания деревьев и культивации неподходящих земель ведет к эрозии почвы и заилению водораспределительной системы, что также влияет на качество воды.
Качество воды не регулируется так, как следовало бы, а государственная система контроля загрязнения воды неэффективна.
