Иссык-Ата кен оруну Бишкектен 78 км түштүк-чыгышта, бир аты менен аталган дарыянын кооз жазыгында, 1750—1800 м абсолюттук бийиктикте жайгашкан. Токмак, Канттан, Юрьевка айылынан Иссык-Ата курортуна жакшы авто жолдор бар, алар Чүй жазыгындагы калктуу конуштар менен бул курорттун бардык мезгилдерде жана жыл бою байланышта болушун камсыз кылат.
Иссык-Ата термалары белгилүү жана, албетте, байыркы замандарда дарылоо үчүн колдонулган, анын далили катары археологдордун пикири боюнча X кылымга таандык Будда сүрөтү чегилген мөңгү ташы кызмат кылат. Иссык-Ата жөнүндө адабиятта биринчи жолу А. И. Северцов (1864) жазган, ал эми бул жердеги булактарды биринчи илимий сүрөттөгөн Петербургдун тоо институтунун профессору И. В. Мушкетов (1875) болгон, ал ошол учурда Тянь-Шандагы башка термалык сууларды да изилдеген. Кийинки жылдарда бул кен оруну көптөгөн адистердин көңүлүн бурган, бирок 1956-жылы узак убакыттан бери иштеп жаткан курорттун аймагында биринчи буроо иштерин уюштуруу менен, 20 жылдан кийин мамлекеттик пайдалы кендер запастары боюнча комиссия тарабынан термалык суулардын запастарынын бекитилиши менен аяктаган. Бирок, изилдөө иштеринин кыйынчылыктары бул кен оруну боюнча курорттун маанилүү өнүгүшүнө тоскоол болгон жок, азыркы учурда республикадагы эң популярдуу курорттордун бири болуп калды.
Термалык сууларды чоң агым менен (25 л/с ашык) буроолор аркылуу алуу улантылып жатат, анын ичинде температурасы 40°С чамасында (буроолордо максималдуу 55°С). Термалык суу метаморфикалык же магматикалык жыныстарга байланыштуу болбосо да, хлорид-сульфат натрий курамына ээ, минерализациясы 0,3 г/л чамасында; буроолордон алынган сууда кремний кислотасынын мазмуну 45 мг/л жетет, бул кургак калдыктын салмагынан 15% ашык жана Кыргызстандагы термдер үчүн салыштырмалуу жогору. Фтордун мазмуну боюнча иссык-аталык суу республикадагы термалык сулар арасында өзгөчө айырмаланбайт — анын концентрациясы 6-8 мг/л, рудалык элементтерден литий, молибден, мыс, свинец, цинк табылган, бирок фондук концентрацияларды анча ашпайт.
Минерализациясы жана макрокомпоненттердин катышы боюнча Иссык-Ата термалары Европа өлкөлөрүндө, Камчаткада, Сибирде жана Кыргызстан аймагында көптөгөн аналогдору бар. Алар Кульдур типиндеги аз минералдашкан азоттуу термдардын көптөгөн тобуна кирет (Хабаровск крайындагы кен оруну жана курорттун атынан), ал өз кезегинде Иссык-Ата типиндеги термдер тобуна ат берди.
Иссык-Ата кен оруну боюнча термалык суулардын изилденген запастары курорттун реалдуу муктаждыктарынан эки эсе көп жана келечекте геологиялык изилдөө иштеринин жүрүшүндө көбөйүү мүмкүнчүлүктөрүнө ээ, ошондуктан гидроминералдык базанын мүмкүнчүлүктөрү боюнча курортту өнүктүрүүнүн келечектери эң ыңгайлуу. Ошол эле учурда, Иссык-Ата геологиялык-структуралык позициясында курорттун чыгышында 10 км аралыкта Туюк дарыясынын жазыгында, Иссык-Атага окшош, жылуу суулардын чыгыштары бар экенин эске алуу керек.
Кыргызстандын минералдык суларын жакшы билген Н. И. Катаева белгилегендей, термалык, температурасы аномалдуу сулар Кыргыз тоосунун түндүк капталында, анын бутактарынан 10 км аралыкта, бир широттук сызык боюнча жайгашкан. Бул факт термалык суларды салыштырмалуу терең эмес буроолор менен табууга үмүттөнүүгө мүмкүндүк берет, бул термалык суларды пайдалануу мүмкүнчүлүктөрүн дагы кеңейтет.
