Его деятельность активно способствует развитию науки и образования в Кыргызстане.
Алтай Борубаев является академиком Национальной академии наук Кыргызской Республики. Он удостоен Межгосударственной премии СНГ «Звезды содружества», дважды получал Государственную премию Кыргызской Республики в области науки и техники, а также является заслуженным деятелем науки, государственным советником первой степени и кавалером ордена «Манас» III степени, а также ордена «Содружество» Межпарламентской ассамблеи СНГ. В настоящее время он занимает пост директора Института математики Национальной академии наук.
Борубаев является автором 16 научных монографий и книг, а также более 130 научных статей, которые были опубликованы в 15 странах. Он активно выступал с научными докладами в университетах 39 стран мира и под его руководством в стране прошло свыше 20 международных научных конгрессов и конференций.
Он также занимает пост президента Союза ученых Кыргызстана, является членом Президиума Национальной академии наук КР и руководителем Кыргызского математического общества. Кроме того, он является членом редакционных советов нескольких международных научных журналов по математике.
