Евгения Михайловна родилась 7 апреля 1940 года.
После завершения аспирантуры в Институте экспериментальной биологии Академии наук Казахской ССР в 1969 году, Лущихина начала свою карьеру как лаборант, затем стала главным научным сотрудником и заведующей лабораторией.
Позже она возглавила лабораторию в Институте биологии и почвоведения Академии наук Кыргызской ССР, а затем лабораторию генетики и биотехнологии в Институте биотехнологии НАН КР, где работала до 2020 года.
Евгения Лущихина была дочерью академика Михаила Лущихина и продолжила его дело, занимаясь созданием новой породы Кыргызского горного мериноса.
В НАН КР отметили, что «она была единственной женщиной в этой профессии».
