Исторические данные свидетельствуют о том, что развитие пассажирских перевозок в городе началось с середины XX века. На 1996 год Нарын имел надежные автомобильные связи со всеми селами Нарынской области.
К основным магистралям, проходящим через Нарын, относятся республиканская дорога Нарын – Балыкчы и международная трасса Нарын – Торугарт – Кашгар (КНР). Через Балыкчы обеспечивалась связь с другими регионами Кыргызстана (по состоянию на 1996 год).
В 1996 году выручка от пассажирских перевозок составила 174 467 сомов.
Автовокзал underwent полную реконструкцию в 2025 году и был вновь открыт для эксплуатации. Теперь он находится в муниципальной собственности города, что привело к улучшению условий обслуживания.
Второй этаж здания был переоборудован под общежитие, а на первом этаже созданы зал ожидания и различные сервисные зоны. Вокруг автовокзала проведен асфальт.
Среди 807 миллионов сомов, выделенных на капитальный ремонт из Стабилизационного фонда президента, 53 миллиона сомов были направлены на реконструкцию автовокзала.
