На данный момент в музее трудятся 7 сотрудников.
Это одноэтажное каменное здание с характерными рустованными стенами, придающими ему основательный вид, было возведено в 1887 году купцом М.Н. Ильиным, занимавшимся скотоводством, в самом центре Каракола. Изначально оно служило летним домом для его семьи до революции.
С 1918 по 1920 годы в этом здании располагались Уездный совет депутатов, штаб регионального Революционного комитета, военкомат, библиотека и Дом обороны.
1 ноября 1948 года по постановлению Совета министров СССР здание было преобразовано в музей.
С 17 января 2001 года, согласно решению Каракольского городского кенеша, музей получил свое нынешнее название — «историко-краеведческий музей города Каракол».
В экспозиции музея представлены артефакты, отражающие богатую историю и культуру Каракола, а также элементы традиционной кочевой жизни кыргызов.
Отдельный зал музея посвящен постоянной фотовыставке работ Эллы Майер, выдающейся швейцарской путешественницы, ставшей первой официально зарегистрированной европейской женщиной-путешественницей, которая исследовала Центральную Азию. Черно-белые снимки, сделанные Майер, запечатлели эпоху до того, как Центральная Азия вошла в состав Советского Союза, и их образы остаются актуальными, отражая исчезнувший мир.
Всего музей включает в себя семь залов.
