Озер в Чуйской долине и ее горном обрамлении сравнительно мало и все они мелкие. В Кыргызском хребте насчитываются несколько десятков горных озер. В подавляющем большинстве это очень мелкие озера, имеющие в поперечнике не более 0,1-0,2 км. Основная масса озер расположена на высотах 3000- 3500 м. Они подпитываются талыми водами ледников и снега, а также дождевыми водами. В бассейне реки Ысык-Ата имеется три озера общей площадью 0,09 км2. Крупными из них являются Кок-Мойнок, лежащий на высоте - 2723 м, Кара-Коль - 2873 м и Ак- Коль - 3114 м. В бассейне реки Аламюдюна заложено несколько озер площадью 0,3 км2. Крупное озеро завального происхождения - Кольтер Кегетинский лежит на высоте 2733,6 м. Длина его 0,7 км, ширина до 0,5 км, площадью 0,2 км2 плотина озера является громадным моренно-обвальным образованием. Озерные воды, фильтруясь через тело плотины, выходят у ее подножья в виде мощного родника. В месте выхода родниковых вод образовался глубокий овраг, явно имеющий тенденцию к дальнейшему врезанию в тело плотины. Кроме того, имеются сведения, что особенно в многоводные, влажные годы озеро имеет и поверхностный сток (например, так было в 1979 году). Оба эти обстоятельства делают возможным катастрофический прорыв озера Кольтор.
В равнинной части Чуйской долины особенно к северу от БЧК имеется ряд мелких искусственных водоемов. Они играют определенную роль в рыбоводстве. Наиболее значительными из них являются нижне- и верхне- Ала-Арчинские водохранилища, озера Спартак, Сокулук, Комсомольское и др. Многие из этих озер и водохранилищ особенно вокруг г.Бишкек служат местом отдыха горожан.
В заключение отметим, что реки Чуйской долины являются неотъемлемыми элементами горного ландшафта и представляют чрезвычайный интерес во всех отношениях. Этот интерес вызван тем, что через них осуществляется освоение гор; использование водных ресурсов, строительство дорог, домов отдыха, проведение различного рода спортивно-туристических мероприятий и т.д. Наряду с этим именно в речных долинах происходят всевозможные стихийно-разрушительные процессы в горах: сели, обвалы, оползни, камнепады, снежные лавины, наводнения и др. Поэтому знание хотя бы в общих чертах режима и особенностей горных рек, строения их долин исключительно важно для освоения горных стран и для всех, кто бывает в горах.
