Республика аймагындагы өсүмдүктөр жана жаныбарлар дүйнөсү чоң ар түрдүүлүккө ээ.
Өсүмдүктөрдүн таралышы рельефтин татаалдыгына жараша болот жана кыркактар, жогорку зоналдуулук, склондордун экспозициясы менен аныкталат. Эгер жылуу сүйгөн, кургакчылыкка чыдамдуу өсүмдүктөр түштүк склондордо өссө, түндүк склондордо - суу сүйгөн, музга чыдамдуу өсүмдүктөр бар. Тоо алдыларында полынь жана дерновиндик дан өсүмдүктөрү үстөмдүк кылган жарым чөлдөр өнүккөн. Тоо стептеринде ковыль, типчак үстөмдүк кылат. Луговые степи жогору жайгашкан аймактарды ээлейт.
Тоо-лесо-лугово-степной зонасынын төмөнкү поясында (1700 м чейин) кустарниковые заросли жана жалбырактуу ормандар таралган, ал эми жогорку поясында - шырша, шырша-майда чыршыт ормандары жана арчевники. Чаткаль жана Фергана кыркактарынын склондору үчүн субтропикалык жарым чөлдөр жана тоо стептери мүнөздүү. Ошондой эле грек жаңгагы, кленден турган ормандар бар, алар лесо-лугово-степной зонасынын төмөнкү поясун ээлейт (Кыска географиялык энциклопедия. 1961. Б. 281, 282).
Республика аймагындагы өсүмдүктөрдүн ар кандай бийиктиктерге жана мейкиндиктин өзгөчөлүктөрүнө ылайыкташкандыгына жараша ар кандай түрдөгү чычкан, куш, жапайы жаныбарлар, жапайы жаныбарлар кездешет. Эгер чоң тушканчык, джейран сыяктуу сүт эмүүчүлөр тоо алдыларында жашаса, тоо козусу (текё) жана тоо баран (архар) чоң бийиктиктерде, таштуу жерлерде жашайт. Кар барыстары (илбирс) альпий луговунун бийик поясында таралган.
Кара бөрү, рысь, косуля, горностай, сары бөрү, ястреб-перепелятник, орман чычканы жана башка сүт эмүүчүлөр, куштар, чычкандар ормондордун жаныбарлар дүйнөсүнө ар түрдүүлүк берет.
Көлдөрдө жана дарыяларда 50гө жакын балык түрлөрү кездешет. Чебак, осман, маринка жана башка айрым түрлөр Иссык-Көлдө кылымдар бою жашап келген. XIX кылымдын экинчи жарымында көчүп келген дыйкандар көлдө жана дарыяларда балыктын көптүгүнөн таң калышты. Совет мезгилинде Сон-Көл жогорку көлүндө пелядь, сига адаптацияланган. Республикадагы суу сактагычтарда жана дарыяларда сазан, щука, толстолоб жана башка балыктарды кездештирүүгө болот.
