Жогорку окуу жайларын лицензиялоо жана аттестациялоо. Бир нече жылдан бери республикадагы билим берүү мекемелерин лицензиялоо жана аттестациялоонун бүтүндүк системасын иштеп чыгуу жүрүп жатат. 1994-жылы Кыргыз Республикасынын Билим берүү министрлигинин алдындагы Билим берүү мекемелерин лицензиялоо жана аттестациялоо боюнча Мамлекеттик инспекция түзүлгөн.
Азыркы учурда лицензиялоодон республикадагы бардык билим берүү мекемелери өттү. Бирок, бул процесс жакшыртууну талап кылат, анткени кээ бир билим берүү мекемелери бардыгы менен статусуна такыр туура келбейт. Мисалы, республикада академия жана университет статусуна ээ жеке жогорку окуу жайлары бар, алар билим берүү мекемелерине коюлган талаптарга такыр жооп бербейт. Бүгүнкү күнү 1992-1994-жылдардагы өзгөрүүлөрдүн толкунунда инновациялык статус алган билим берүү мекемелерин аккредитациялоо жүргүзүлүшү керек. Азыркы учурда республикадагы билим берүү мекемелерин аккредитациялоо механизмдери активдүү иштелип жатат.
Кыргыз Республикасынын коомунун бардык тармактарын камтыган кардиналдык демократиялык реформалардын алкагында жогорку билим берүү системасын өнүктүрүүнүн кийинки этабына өтүү зарылдыгы келип чыкты, бул анын компоненттеринин тереңдигине жараша ар кандай реформаларды талап кылат.
Жеке адамга багытталган билим берүүгө жана билим берүү программаларын түзүүдө компетентносттук жакты карап чыгуу пландалууда, билим берүү мекемелеринин жана программаларынын түрлүүлүгү жетишилди, бул окуучуларга билим берүү деңгээлин жана түрүн тандоого мүмкүнчүлүк берет, билим берүүнүн рыноктун талаптарына жана дүйнөлүк билим берүү мейкиндигине интеграциясына көбүрөөк багытталышын камсыздайт.
«Кыргыз Республикасынын өнүгүүсүнүн комплекс негиздери (КОР)» стратегиялык программасынын бир бөлүмүндө (1999) билим берүүнүн келечектеги багыттары белгиленген, ошондой эле 2010-жылга чейин бул тармактын келечектеги өнүгүүсүн камсыз кылган орто мөөнөттүү жана узак мөөнөттүү чаралар системасы берилген.
Койгон тапшырмаларды чечүү үчүн 2002-жылы «Кыргыз Республикасынын билим берүүсүн 2010-жылга чейин өнүктүрүү концепциясы» кабыл алынды, ал билим берүү системасын өнүктүрүүнүн кийинки этаптарын аныктады.
Централизделген аракеттерди Билим берүү министрлигинин жетекчилигинде жүргүзүүдө, жогорку окуу жайларынын автономия принциптерин актуалдаштырууда жетишкен оң тажрыйбага таянышы принципиалдуу мааниге ээ. Мындай структураларды түзүүнү стимулдаштыруу мүмкүн жана керек, бирок бул процессти «жогору жактан» күчөтүү такыр мүмкүн эмес. Ал өлкөнүн жана региондордун конкреттүү шарттарында пайда болушу керек. Келечектеги эки он жылдыкта болуучу демографикалык жарылууну жогорку окуу жайларынын системасын жакшыртуу үчүн максималдуу пайдалануу принципиалдуу мааниге ээ, анткени өз алдынча жогорку окуу жайларынын санын кыскартуу өзүнчө максатка айланбашы керек.
Шексиз, жогорку билим берүү системасын реформалоо, орто мектепти жана мектепке чейинки тарбияны камтыган кийинки процессти өнүктүрүү үчүн принципиалдуу кадам катары каралышы керек. Мындай последовательность маанилүү, анткени орто мектепти реорганизациялоого болгон бардык аракеттер, кадрлар даярдалганга чейин, мектеп системасын реформалоону жүзөгө ашырууга жөндөмдүү болбойт, мааниси жок. Айрыкча, орто мектептеги билим берүү жана тарбия процессинин сапаттуу жакшыртылышы, магистратураны камтыган толук даярдык циклынан өткөн педагогдорго муктаж экендиги боюнча негиздер бар.
