Нефть и газ встречаются в основном по границам Ферганской впадины. К настоящему времени известно семь нефтяных, четыре нефтегазовых, два газовых и одно нефтегазоконденсатное месторождение. По запасам все разрабатываемые месторождения являются мелкими.
Коэффициент продуктивности большинства нефтяных и газовых месторождений низкий, в них содержится много воды.
Основные месторождения разрабатываются в естественном режиме, но объем добычи сокращается. Все разрабатываемые месторождения находятся в поздней стадии отработки, добыча нефти из трудноизвлекаемых коллекторов падает, требуется применение новейшей технологии.
Все работы по добыче нефти в настоящее время ведутся на глубине 4 тыс. м. По мнению специалистов, на уровне 7 тыс. м в уже существующих скважинах и других местах могут содержаться значительные запасы нефти. В глубоко залегающих палеозойских породах прогнозируется наличие нефтяных и газовых месторождений.
В 2001 году в результате совместного проведения буровых работ с канадской фирмой Cadima Petroleum в горной части нефтеносной площади (структуры) Майлуу-Суу открыто крупное месторождение нефти.
