Соңку 15 жыл ичинде орто жалпы билим берүү системасы туруктуу иштеп келди, жалпы билим берүү мектептеринин тармагы жана окуучулардын санынын өсүшү байкалууда. Улуттук статистика комитетинин маалыматына ылайык, 2005-жылы республикада 2045 жалпы билим берүү мектеби иштеп, анда 1121,6 миң окуучу билим алууда. Республикадагы мектептерде билим берүү бир нече тилде жүргүзүлөт: 63,9% окуучу кыргыз тилинде, 24,5% — орус тилинде, 13,5% — өзбек тилинде, 0,3% — тажик тилинде билим алат. Мындан тышкары, этникалык азчылыктар жашаган жерлердеги мектептерде корей, дунган, иврит, уйгур, немис, түрк тилдери эне тили катары окутулат. Кыргызстанда Кыргыз Республикасы Билим берүү министрлиги менен Түркиянын «Себат» педагогикалык ассоциациясы ортосундагы келишимдин негизинде кыргыз-түрк билим берүү мекемелери «Себат» түзүлгөн. Эгер 1992-жылы бир гана лицей иштеп жатса, бүгүнкү күндө «Себат» билим берүү мекемелеринин курамына республикадагы бардык облустарда жайгашкан 13 кыргыз-түрк лицейи кирет, ошондой эле тилдерди жана компьютердик сабаттуулукту үйрөнүү борбору «Секом» жана жеке-мамлекеттик Эл аралык Silk Road мектеби түзүлгөн. Бул окуу жайларда 4 миңден ашык окуучу билим алууда.
2005-жылдан бери Кыргызстанда көп тилдүү жана көп мадалуу билим берүүнү колдоо жана өнүктүрүү боюнча Комплекс программа иштеп жатат.
1990-жылдардан тартып республикада альтернативдүү типтеги жана түрдөгү мектептер менен билим берүү программалары активдүү түзүлө баштады. Азыркы учурда жалпы билим берүү мектеби 10дон ашык ар кандай жалпы билим берүү программаларына ээ. Республикада 380 инновациялык мектеп (жалпы орто мектептердин 22%ы) 147,8 миң бала менен иштеп жатат, бул жалпы окуучулардын 13,7%ын түзөт. Бул 110 гимназия, 65 лицей, 205 профилдик мектептер, аларда айрым предметтер тереңдетилип окутулат.
1992-жылдан тартып республикада мамлекеттик эмес менчик формасындагы жалпы билим берүү мекемелери: жеке мектептер, жеке мектеп-комплекстер, жеке-мамлекеттик лицейлер түзүлө баштады. Бүгүнкү күндө республикада 38 жеке жана жеке-мамлекеттик мектеп бар. Мамлекеттик эмес мекемелердин саны 1994-жылы 7ден 1997-жылы 29га чейин өстү, андан кийин 2005-жылы 25ке чейин кыскарган.
Мамлекет айыл мектептерине өзгөчө көңүл бурат. 2005-жылы айыл мектептеринин саны 1694тү түзүп, бул өлкөдөгү жалпы билим берүү мектептеринин 82,8%ын түзөт. Алардын ичинде 816 миң окуучу билим алууда, же республикадагы жалпы окуучулардын 72,8%ын, ошондой эле 54 миңден ашык мугалим иштейт, бул республикадагы бардык мектептердин мугалимдеринин 72%ын түзөт. Билим берүү реформаларынын натыйжасында айыл мектебинин статусу өзгөрдү. Айыл мектебинин материалдык-техникалык абалы жана билим берүүнүн сапаты, ал жайгашкан облустар жана райондордун экономикалык мүмкүнчүлүктөрүнө, жергиликтүү мамлекеттик администрациялардын жана айыл өкмөттөрүнүн (айыл башкармалыктарынын) билим берүүгө болгон кызыгуусуна, ошондой эле айыл чарба ишканаларынын жана фермердик чарбалардын экономикалык абалына, социалдык чөйрөнүн жалпы абалына көз каранды болуп калды.
Ошондой эле айыл мектеби билим берүү системасында болуп жаткан бардык өзгөрүүлөрдөн четте калган жок. Айыл мектептеринде жардамчы чарбаларды (жылыжайлар, май куюу, ун тартуучу) түзүү активдүү жүрүүдө, калкты тейлөө үчүн (чач тарач, бут кийимди оңдоо, тигүү цехтери) кызмат көрсөтүүчү жайлар ачылууда. Жардамчы чарбалардан жана көрсөтүлгөн кызматтардан алынган акчага мектептерде жарым-жартылай оңдоп-түзөө, билим берүү процессин материалдык-техникалык жактан камсыздоо, аз камсыз болгон жана көп балалуу үй-бүлөлөрдүн окуучуларына жардам көрсөтүү иштери жүргүзүлүүдө.
Донорлордун жана өз каражаттарын рационалдуу пайдалануу окуу китептеринин чыгарылышын кыйла көбөйтүүгө мүмкүнчүлүк берди. Мисалы, 2002-жылы 1506 миң нускада 27 окуу китеби жана 61 миң нускада 18 окуу куралы чыгарылган. 2003-жылы 2188 миң нускада 160 окуу китеби, окуу куралдары, программалар жана китепканалык материалдар чыгарылып, сатып алынган. 2004-жылы 1 миллион 67 миң нускада 65 окуу китеби жана окуу материалдары сатып алынып, мектептерге жөнөтүлгөн, ошондой эле кыргыз, орус, өзбек тилдеринде окутуу үчүн 13 окуу программасы жана 30 китепканалык материалдар сатып алынган.
Орус тилинде окутуучу мектептердин китепканаларынын фонддорун жаңылоодо 1997-жылы Россия Федерациясы Кыргыз Республикасына берген мамлекеттик кредиттин каражаттары жана КР Билим берүү министрлигинин айлануучу каражаттары колдонулган.
Кабыл алынган чаралардын натыйжасында мектептердин окуу китептери менен камсыздалышы кыргыз тилинде окутуучу мектептер үчүн 83,0%, орус тилинде окутуучу мектептер үчүн — 87,9%, өзбек тилинде окутуучу мектептер үчүн — 75,2%, тажик тилинде окутуучу мектептер үчүн — 63,7%ды түзөт. Республика боюнча мектептердин окуу китептери менен камсыздалышы 77,4%ды түзөт. Ошентип, 2003-жылга салыштырганда окуучулардын окуу китептери менен камсыздалышы жакшырды жана 2010-жылга чейин көп тилдүү жана көп мадалуу билим берүүнү колдоо жана өнүктүрүү боюнча Комплекс программасынын алкагында бул маселени толугу менен чечүү мүмкүнчүлүгү бар.
Орто билим берүүнүн сапаты. Билим берүүнүн сапатын кепилдөө маселелерине чоң маанилүү көңүл бурула баштады. 1993-жылы жалпы билим берүү мектептеринин畢гиптеринин билимдерин баалоодо тесттик методика киргизилген Улуттук тестирлөө борбору түзүлгөн. Борбордун иштеп жатканына бери 10 миңден ашык окуучу милдеттүү түрдө тестирлөөнөн өттү, ал эми 70 миңдей мектеп畢гиптери өз каалоосу менен тестирленди.
Билим берүүнүн сапатын баалоодо Кыргызстандын эл аралык баалоо программаларына катышуусу оң роль ойноду. ЮНЕСКО жана ЮНИСЕФтин каржылык колдоосу менен 2000-жылы «4-класстын окуучуларынын жетишкендиктерин мониторингдөө», 2002-жылы — «8-класстын окуучуларынын жетишкендиктерин мониторингдөө» өткөрүлдү. Мониторингдин жыйынтыктары билим берүүнүн сапатын жогорулатуу жана көз карандысыз баалоо системасын киргизүүнү улантуу зарылдыгын көрсөтүп турат.
Республика ошондой эле Экономикалык кызматташтык жана өнүктүрүү уюму (ЭКӨУ) тарабынан жүргүзүлгөн PISA — International Student Assessment (PISA) программасына катышууда.
Окуучулардын билимдерин объективдүү баалоо жана жогорку билимге адилеттүү жетүүнү камсыз кылуу максатында 2002-жылы мектеп畢гиптери үчүн ВУЗдарга кирүүчү биринчи Жалпы республикалык тестирлөө киргизилген.
