Нарынский Государственный заповедник находится в 50 км восточнее города Нарына на левом берегу реки. Главными объектами охраны в заповеднике являются ель Шренка и популяция марала.
Заповедник организован в 1983 году, площадь его составляет 36969 га. Кроме уже названных представителей флоры и фауны здесь охраняется 20 видов млекопитающих, более 100 видов птиц и около 500 видов растений. Кроме марала здесь обитают: снежный барс, рысь, медведь, архар и хищные редкие птицы. Из видов, занесенных в Красную книгу Кыргызской республики, в заповеднике обитают 5 видов млекопитающих, 6 видов птиц, 10 видов насекомых. В заповеднике функционирует маралий питомник, который образован для восстановления популяции марала и для организации в перспективе пантового хозяйства. В заповеднике разработано 3 туристских маршрута: однодневный, двухдневный и однонедельный туры. Во время туров организуется ночлег в юртах.
В гребне хребта, возвышающегося над окрестностями г. Нарына, выделяется очень красивая гора Ала-Мышык (Пестрая кошка), названная так из-за исключительного разнообразия слагающих ее пород. Склоны горы покрыты зелеными пятнами тянь-шаньских елей. Аламышыкская пещера находится в 6 километрах к западу от города Нарына, в 250 метрах от Нарынского ретранслятора, установленного на северном склоне хребта. За входом круглый коридор усеян костями скота, больше всего лошадиными. Затем полость пещеры несколькими ступенями уходит в глубь, горы. Протяженность пещеры - 162 метра. Глубина - 65 метров. Пещера имеет довольно сложную конфигурацию - относительно просторные полости соединены узкими коридорами. На полу - завалы из небольших скальных обломков и ониксовых натеков красивых красных тонов. Полость состоит из нескольких небольших залов, врезанных в толщу известняков. Залы и переходы пещеры украшены сталактитами и сталагмитами необычных ярко-красных оттенков. Вход, обращенный на юго-запад, открывает красивую панораму долины Нарына.
