Кыргыз-Ата табигый паркы Кыргыз-Ата дарыясынын бассейнине жайгашкан, Кичик-Алай жотосунун түндүк капталынан агып чыккан, Ош шаарынан Иски-Наукат айылына бараткан жолдон 40 км алыстыкта. Долонунун төрт тарабын Кичик-Алай жотосунун ак кар менен капталган, кооздугу менен таң калтырган жогорку чокусуна окшош жогорку чокусундагы чокулар курчап турат. Таштар ар кандай түстөгү мармар менен жаратылган жонокой кальциттерден турат.
Аймактын жогорку бөлүгүндө Мазар, Калдай жана Карагой урочищолору бөлүнүп турат, бул жерде табияттын бардык кооздуктары бириктирилген. Кыргыз-Атанын жогорку бөлүгүндө Первомайский ашуусу жана Кичик-Алай Чыгыш капчыгайына алып бараткан башка ашуулар жайгашкан.
Жогорку бөлүктөн көптөгөн чокулардын көрүнүшү ачылат, алардын көбү жалпы кабыл алынган аталыштарга ээ эмес. Дарыянын жазыгы толугу менен мүнөзүн өзгөртөт: тар терең каньондор кең, кооз тоо урочищолорунун бөлүктөрү менен алмашат, алар арча токойлорунун жашылчалыгына чөмүлүп кеткен.
Төмөнкү агымда, Кыргыз-Ата жана Хосчана дарыяларынын куюлушу Наукат өрөөнүндө Араванское Данги деп аталган каньон жайгашкан. Бул жерде дарыя Туя-Муюн тоо массивинин жарым километр бийиктиктеги таш жоондугун жарып өтөт. Араван-Сай дарыясынын оң жээгиндеги тик дубалдарда тоо козулары, аттар жана ритуалдык белгилердин сүрөттөрү, Наукаттагы ташка чегилген сүрөттөр катары белгилүү.
Каньон аймагында кызыктуу үңкүрлөр бар, аларга баруу оңой. Кыргыз-Ата капчыгайында дарыянын орто агымында анын сол жээгинде 30 га аянтты ээлеген бирдей аталыштагы ботаникалык заказник жайгашкан, ал шафран жана кээ бир тюльпан түрлөрүнүн өсүшүн коргоо максатында түзүлгөн.
Бул жерде бир нече минералдык суу булактары бар. Алардын арасында Туя-Муюн аталган термалды булак, ошол эле аталыштагы тоо массивинде жана Иски-Наукат булагы Араван-Сай жана Ак-Буура дарыяларынын ортосунда жайгашкан. Кыргыз-Ата аймагында тарыхый-мәдени эстеликтер, негизинен байыркы шаарлар жана көрүстөндөр көп, алардын аймагында керамика, курал-жарак, жумушчу шаймандар, кооздуктар, күнүмдүк турмушка керектүү буюмдар табылган.
