Вакунов белгилегендей, биргелешкен иштин негизги багыттарынын бири билим берүү болуп саналат. Эң маанилүү долбоорлордун бири Кыргызстанда Россия Федерациясынын каржылоосу менен жети жаңы жалпы билим берүүчү мектептерди куруу. Бул долбоор "президенттик" статусун алды, анткени анын башталышы эки өлкөнүн мамлекет башчыларынын катышуусунда болду.
Элчи бул долбоорду ишке ашыруу Кыргызстандагы билим берүү системасына жүктөмдү жеңилдетүүгө жардам берерин баса белгиледи, анткени калктын тез өсүшү жана окуучулардын санынын көбөйүшү байкалууда. Жаңы мектептердин ар бири 1224 окуучуга ылайыкталат жана жергиликтүү өзгөчөлүктөрдү эске алуу менен россиялык билим берүү стандарттары боюнча иштейт.
Мектептер Россиянын каражаттары менен курулат, ошондой эле мугалимдердин эмгек акысы сыяктуу иштөө үчүн каржылоону алышат. Алгач Бишкекте, Караколдо жана Баткенде үч мектепти 2027-жылдын 1-сентябрына чейин ачуу пландалууда. Андан ары окшош билим берүү мекемелери өлкөнүн башка аймактарында да пайда болот.
Мындан тышкары, кыргыз мектептерин орус тили жана адабияты боюнча окуу китептери менен камсыздоо аркылуу колдоо улантылууда. Россия менен Кыргызстан ортосундагы 26-ортомемлекеттик комиссиянын алкагында кыргыз окуучуларына 651 миң адаптацияланган окуу китептери берилди. Бул иштер улантылат.
Элчи билим берүү тармагында мындан аркы кызматташтыктын негизин Россия менен Кыргызстан ортосунда бирдиктүү билим берүү мейкиндигин түзүү боюнча Кыргызстандын президенти Садыр Жапаровдун сунушу жана Владимир Путин тарабынан колдоосу деп атады. Бул демилгени АНО "Евразия" ишке ашырат.
Жогорку билим берүү боюнча, учурда Россиянын жогорку окуу жайларында Кыргызстандан келген 11 миңден ашык студент билим алууда, алардын 5400ү бюджеттик негизде билим алууда. 2025-жылы Кыргызстандын таланттуу жаштары үчүн жол кире, жашоо жана медициналык камсыздандыруу чыгымдарын жабуучу гранттар киргизилген.
Элчи ошондой эле жогорку билим берүүнүн флагмандык долбоорунун алкагында Кыргыз-Россия Славян университетин (КРСУ) модернизациялоону белгиледи. Жакында университеттин өнүгүү программалары бекитилген попечительдик кеңештин жыйыны өттү.
Россия тарап КРСУнун жаңы кампусун куруу үчүн каражат бөлдү, ал 15 миң студентти кабыл алууга мүмкүнчүлүк берет. Кыргызстан болсо бул долбоор үчүн 30 гектар жер участокторун берди. Меморандум жана орток өкмөттүк чечимдер даярдалган, азыр эки өлкөнүн парламенттери тарабынан ратификациялоо процессинде.
